Revista Colombiana de Microbiologia Tropical

Análisis de Pseudomonas aeruginosa con endonucleasas de restricción en pacientes con fibrosis quística y otras entidades

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Javier A Baena, Claudio J Gómez, Doris E Gómez

RESUMEN

Pseudomonas aeruginosa es un patógeno oportunista que coloniza los pulmones de los pacientes con Fibrosis Quística (FQ), asociándose con alta mortalidad de la enfermedad. Se desconoce si estos pacientes tienen una misma cepa en común que podría estar relacionada con el tipo de resistencia. El objetivo fue analizar los patrones moleculares de aislados de P. aeruginosa en pacientes con FQ y de pacientes con otras entidades diferentes a Fibrosis Quística en Cartagena. Se realizó extracción de ADN genómico y plasmídico de seis aislados de pacientes con Fibrosis Quística y seis de pacientes con otras patologías obtenidos de muestras enviadas por hospitales de la ciudad y tres aislados de cepas estándar para control, posteriormente se realizó digestión enzimática con endonucleasa de restricción EcoR I. Los fragmentos obtenidos por digestión enzimática se corrieron en gel de agarosa 1%. Al analizar el patrón de bandas se observa que todos los aislados provenientes de pacientes con FQ comparten un patrón característico de tres bandas lo que indica que posiblemente se trata de la misma cepa. Entre los aislados de pacientes con patologías diferentes se observa variedad de patrones  en relación con los obtenidos en aislados de pacientes con FQ lo cual es compatible con los múltiples orígenes de la muestras y posiblemente se trate de cepas diferentes. En conclusión la caracterización molecular de P. aeruginosa por medio de digestión con enzimas de restricción permite diferenciar las características taxonómicas de estas lo que podría asociarse con susceptibilidad antimicrobiana, cuadro clínico y respuesta al tratamiento.

Palabras clave: endonucleasas de restricción, fibrosis quística, plásmidos Pseudomonas aeruginosa.

ABSTRACT

Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen which colonizes the lungs of cystic fibrosis patients (CF) associating with the high mortality of this disease. It’s unknown if these patients have a common strain or if it’s a different one that could be isolated in patients with another kind of illnesses. Our aim was to analyze molecular patterns of P. aeruginosa isolated from CF patients and clinical samples of patients with other diseases in Cartagena. We performed an extraction of genomic DNA and plasmids of six isolates from CF patients, six from patients with diseases different to CF that we obtained by means of hospitals in Cartagena and three isolates of standard strains to control our experiment. Later on, we performed a macrorestriction with endonuclease EcoR I of all the isolates. The fragments obtain by enzymatic digestion were visualized by an agarose gel 1% electrophoresis. When analyzing the molecular patterns we observed that all the isolates from CF patients have a common characteristic pattern of three bands which means that it’s possible the same strain. Among the isolates from patients with other kind of diseases we observed a wide variety of patterns compare to those we obtain from CF patients, that’s compatible with the multiple origins of the samples and possibly they are different strains. We conclude that molecular characterization of P. aeruginosa by digestion with restriction endonucleases allows us to differentiate the taxonomic characteristics of these bacteria and we could associate that with antimicrobial susceptibility, clinical outcome and response to treatment.

Keywords: cystic fibrosis, restriction endonucleases, plasmids, Pseudomonas aeruginosa


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